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El duelo en tierras norteñas acabó igualado 2-2, pero Carlos Flores daría inicio a su historia con Universitario, equipo al que regresaría en el 2005 después de haber jugado en innumerables clubes, tanto en el fútbol local como en el extranjero, y en la selección peruana.
En su primera etapa con los merengues, "Kukín" se mantuvo en la institución todo 1995, para después fichar por el San Agustín. Posteriormente, el ex volante tuvo su experiencia fuera del país al vestir los colores de Al-Hilal de Arabia Saudita, Aris Salónica de Grecia, Atlético Paranaense de Brasil, Belgrano de Argentina y Atlético Pereira de Colombia.
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Con la "blanquirroja", Flores participó en varios amistosos y encuentros de Eliminatorias, siendo uno de los partidos más recordados el que disputó el cuadro nacional contra Holanda en 1998, donde el ex merengue demostró todo su talento frente a la "Naranja Mecánica".
Flores se retiró como futbolista en el 2012 con el Cobresol, sin embargo, "Kukín" dejó su huella en todos los clubes a los que defendió. En febrero del 2019, Carlos dejaría este mundo, pero los fanáticos recordarán las asombrosas jugadas que regaló en el "verde".
